蛋白提取
蛋白樣品提取是蛋白定量和分析的基礎(chǔ)。天然蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)、化學(xué)性能各異,選擇適當(dāng)?shù)募毎呀庖褐苽涞鞍讟悠分陵P(guān)重要。選擇細胞裂解液時,除了要考慮蛋白產(chǎn)量,還要考慮所選擇的一抗的是否能識別線性的抗原表位。一些含有十二烷基硫酸鈉(SDS)和強離子去污劑(如脫氧膽酸鈉等)的蛋白質(zhì)裂解液能夠從組織或細胞中提取出大量的蛋白質(zhì),適用于PAGE,Western blot等檢測;但由于這類裂解液易使蛋白變性,因而不適于免疫共沉淀(Co-IP)等實驗。當(dāng)使用某些只能識別非變性的抗原表位的抗體時,應(yīng)該選擇不含去垢劑或含有較溫和的非離子去污劑(如NP-40,Triton X-100等)的裂解液,而不能使用含有SDS和強離子去垢劑的蛋白質(zhì)裂解液。
蛋白濃度測定
確定蛋白樣品濃度對許多實驗都是至關(guān)重要的。通常大多數(shù)蛋白樣品的濃度可以通過比色測定法定量。根據(jù)一些特殊化學(xué)試劑與蛋白質(zhì)結(jié)合發(fā)生顏色變化的原理,使用分光光度計或酶標儀檢測特定波長下的吸光值,通過與蛋白標準品進行比較,可以換算出樣品中的蛋白含量。Bradford蛋白質(zhì)定量試劑(Cat. No. E161-01)具有靈敏度高、簡便快速、價格低廉的特點;BCA蛋白質(zhì)定量試劑(Cat. No. E162-01)可提供更高的靈敏度和準確性,而且不受去垢劑的影響,更適宜微量蛋白的測定。
蛋白質(zhì)電泳和Western blot
蛋白質(zhì)電泳是分離、鑒定蛋白質(zhì)分子量和濃度的重要方法,尤其是聚丙烯酰胺凝膠電泳(Po l yac r y lamide Ge l Electrophoresis,PAGE)。丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺可聚合形成具有分子篩效應(yīng)的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)聚合物,作為電泳時的固相支持物。進行非變性PAGE(Native PAGE)時,蛋白質(zhì)在電泳過程中保持完整的狀態(tài),并依三種因素分開:分子量大小、形狀和所帶電荷。變性PAGE(SDS-PAGE)中,添加了作為變性劑和助溶劑的陰離子去垢劑SDS。SDS一方面可以打開蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的氫鍵,破壞蛋白質(zhì)的二級和三級結(jié)構(gòu),消除蛋白質(zhì)間形狀上的差異;另一方面可以和解聚后的氨基酸側(cè)鏈按比例結(jié)合,使得蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物所帶的負電荷大大超過蛋白質(zhì)本身的電荷量,消除了蛋白質(zhì)間的電荷差異。因此,在SDS-PAGE中,蛋白質(zhì)在電場下的遷移速率只和其分子量大小相關(guān)。
不同濃度Tris-Glycine凝膠的*線性分離范圍
免疫印跡法(Western blot)是鑒定蛋白質(zhì)和多肽,以及檢測蛋白表達水平常用的手段。該技術(shù)通常是將經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)或多肽分子轉(zhuǎn)移到固相載體(PVDF膜或硝酸纖維素膜)上,通過目標蛋白的特異性抗體(一抗)進行免疫反應(yīng),再與酶標記的第二抗體(二抗)反應(yīng),經(jīng)過底物顯色或發(fā)光,從而檢測到特異性目的蛋白。
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